Il ne s'agit autre que la suite du périple du jeune Teppei Takamiya et de son B't X, qui tentent par tous les moyens possibles de délivrer Kotaro, le grand frère de Teppei des mains de la Mecanicae Impérium (l'empire des machines). Aidé dans sa quête par Fhou (Fao), Karen et Hokuto, ils se rapprochent doucement mais surement de la base de l'empire, mais le temps presse car l'éveil du B't Rafaello est proche et l'empire lâchent à leurs trousses les redoutés Hepta, généraux de la terreur...