L'équipe d'Anko Matarashi, composée aussi de Ranka, Tokuma Hyûga et de Muta Aburame en charge de la traque de Kabuto s'aperçoit qu'il est accompagné de Tobi dans le repaire de l'Akatsuki, et qu'une armée entière s'y dissimule. Ils seront pourchassés par l'unité d'embuscade composée de Deidara, Sasori, Shin de la racine et un ninja traqueur, tous ressuscité grâce à l'Edo Tensei. S'en suit une bataille contre l'unité d'embuscade de l'alliance shinobi. Gaara tient un discours devant les armés qui mobilisera les troupes. Plusieurs fronts livrent bataille sous les ordres du quartier général. Bee entraîne Naruto à la bombe biju, l'ultime jutsu des jinchuriki, ce dernier ne se doute pas qu'une guerre pour les protéger à lieu. L'unité de Kakashi, de Kitsuchi et celle de darui sur la plage ouvrent les hostilités et celle de Gaara se tient en position face à d'anciens Kage, dont son propre père.