Les nations de la Terre ont migré dans l'espace sur des colonies portant chacune leur nom (Neo Japan, Neo France...). Afin d'éviter les guerres de pouvoirs entre elles, le Gundam Fight fut instauré : tous les quatre ans, les Colonies envoient sur Terre un mobile fighter hautement perfectionné, le Gundam, qui représentera leur nation et se battra contre les autres. À l'issue du combat, un seul Gundam devra rester, ce dernier gagnera le titre de "Gundam des Gundam" et son pays se verra gouverner les autres jusqu'au prochain Gundam Fight.

Lors du 13ème Gundam Fight, Domon Kasshu, le représentant de Neo Japan, est également en mission secrète : il doit tout faire pour retrouver et détruire le Devil Gundam, un mobile fighter terrifiant conçut par son père et son frère Kyoji. Son père fut placé en sommeil cryogénique pour avoir créé le Devil Gundam, et son frère est porté disparu après sa fuite avec ce mobile fighter illégal.

Mais Domon doit aussi affronter les représentants des autres nations dans des combats impressionnants.