Sur une singulière planète située bien au-delà du système solaire, Cybertron, dont la particularité est d'être entièrement constituée de métal et d'abriter des êtres robotiques capables d'auto-transformation, une guerre civile fait rage depuis maintenant des temps immémoriaux, opposant les pacifiques Autobots aux Decepticons, assoiffés de conquête et de pouvoir.
Les incessants conflits ont vite fait de provoquer une pénurie énergétique bilatérale, obligeant ainsi le leader des Autobots, Optimus Prime, à partir à la recherche de nouvelles ressources accompagné d'une poignée de soldats à bord de l'Ark. Les Decepticons, dirigés par le cruel Megatron, se lancent à leur poursuite, mais les 2 clans se retrouvent pris dans une pluie de météorites et vont s'écraser sur la 3ème planète d'un système, la Terre, alors à l'ère préhistorique.