Il y a des millénaires, le peuple de Mykènes (la ville de Mycène pour les adeptes de la mythologie grecque) avait bâti des robots géants pour soumettre les autres peuples. Mais un cataclysme détruisit la cité et força les mykéniens à trouver refuge dans les profondeurs de la Terre. Les plus grands guerriers eurent leur cerveau connecté à un robot géant. Koji Kabuto (Alcor) est le héros de cet animé, avec Tetsuya. Aux commandes de Great Mazinger, un robot géant créé par son père, ils doivent combattre l'Empereur des Ténèbres de Mykénes, réveillé après des millénaires de sommeil pour conquérir le monde à l'aide de ses robots géants. Koji devra faire face tel Goldorak à toutes sortes de robots.