Né le 24 décembre 1970 en Californie (Etats-Unis).

Fils de l'ancien PDG de Disney, Breck Eisner se dirige vers la télévision et le cinéma. Après une formation à la section cinéma de l'USC, il débute en réalisant des publicités. On lui confie en 2000 le pilote de la série télévisée The Invisible man, et Steven Spielberg le prend sous son aile. Producteur de la mini-série Taken, Spielberg lui en confie la réalisation en 2002. L'année suivante Esner met en scène le téléfilm La Voix des crimes.

Le cinéaste passe à la réalisation pour le cinéma en 2005 avec Sahara, où il dirige Matthew McConaughey et Pénélope Cruz.

Le film est un échec total, aussi le metteur en scène décide de se consacrer à des projets de remakes. En 2010 Breck Eisner sort The Crazies, inspiré du film d'horreur de George A. Romero.